2023年4月10日上午，第138期消化道营养精品学术沙龙在逸夫楼2064举办。本期的学术沙龙由消化道微生物实验室的硕士生王然、张凯、梁旭和博士生郝壮分别做出汇报。特选一个精彩的汇报与大家分享。

硕士生张凯对文献《Integrated multi-omics of the gastrointestinal microbiome and ruminant host reveals metabolic adaptation underlying early life development》-《胃肠道微生物组和反刍动物宿主的综合多组学揭示了早期生命发展的代谢适应》进行了汇报。

反刍动物的胃肠道微生物组及其代谢影响极大地影响宿主的代谢和生长。然而，对宿主微生物组轴上发生的双向相互作用的完整理解仍然难以捉摸，尤其是在生命早期的关键发育阶段。研究人员提出了一种综合的多组学方法，该方法同时解决了梅花鹿（日本鹿）生命早期三个关键阶段的五个胃肠道区域微生物群的分类和功能特征，以及肝脏、肌肉、尿液和血清的代谢特征。

研究对宿主血清、尿液和肌肉（腰最长肌）中代谢物的进行了分析，结果表明随着时间的推移，脂肪酸的变化与体重的增加同时发生。转录组学和代谢组学分析结果表明，脂肪酸β-氧化以及色氨酸和支链氨基酸的代谢在调节肝脏代谢中发挥着重要作用。在胃肠道的不同区域，我们证明了一个复杂多变的细菌、病毒和古菌群落在出生后不久就在胃肠道中定植，而微生物的演替是由中心种群的合作网络驱动的。此外，胃肠道挥发性脂肪酸浓度的标志是与甘露糖（瘤胃）和氨基酸（结肠）代谢相关的微生物代谢途径丰度增加。在不同的胃肠道组织中也发现了显著的功能变化，这主要是由与瘤胃上皮中活性氧相关的宿主脂肪酸代谢以及小肠和大肠中的强烈免疫反应决定的。研究人员揭示了坏死和细胞凋亡分别在促进回肠和结肠上皮发育中的可能作用。研究结果为胃肠道微生物组和反刍动物早期代谢生长的相关机制提供了一个全面的视角。