2023年12月4日下午，动物消化道营养国际联合研究中心第157期消化道营养精品学术沙龙在逸夫楼2064顺利举办。本期的学术沙龙由消化道微生物实验室的硕士生关峰、刘晓英、张树孟和唐一骏做文献汇报，动物消化道营养国际联合研究中心的老师学生参与此次沙龙。特选唐一骏同学的精彩汇报进行展示。

硕士生唐一骏对文献《Systematic and quantitative view of the antiviral arsenal of prokaryotes》-《原核生物抗病毒库的系统和定量观点》进行了汇报。

与大多数生物一样，维生物也有属于自己的免疫系统，是一种复杂而高效的天然防御机制，维护着细菌在恶劣环境中的生存。与真核生物的免疫系统相比，原核生物的免疫系统更为简单，但同样发挥着至关重要的作用。通过研究这类系统的机制与原理，可能为人类更加深入的了解微生物的生命规律以及对改造微生物提供前提与理论基础。例如CRISPR-Cas9技术的本质就是一种细菌的Defense System。本文开发了一个流程，通过HMM模型去鉴定原核生物体内的Defense System，并通过分析鉴定的结果发现门、物种和毒株之间的抗病毒策略存在巨大差异。抗病毒系统组成的变化与基因组大小、病毒威胁和生活方式特征相关。

作者得出结论：原核生物的抗病毒库变化很大具体体现在1、原核生物平均编码五种抗病毒系统。2、当基因组编码大量抗病毒系统时系统，这些抗病毒系统很可能属于不同的抗病毒系统家族。3、非常小的基因组（<2 Mbp）编码很少的防御系统，而较大的基因组编码更多的防御系统。4、与我们的经验猜想不同，抗病毒系统和原噬菌体的数量之间并不存在显著的负相关性。不同物种间具有非常多样化的防御武器库。此外，抗病毒系统家族具有异质分布，RM 系统是最丰富的DefenseSystem，其次是CRISPR-Cas。除了这些系统之外的系统的频率都低于 20%。核酸降解似乎是原核生物抗病毒防御的主要模式。抗病毒系统的分布是异质的，并受到基因组位置和系统发育的影响。

唐一骏同学最后也做出了对文章的总结，本文提供了一个定量分析原核生物抗病毒库的框架，通过创建一种工具来检测所有已知的原核抗病毒系统；基于MacSyFinder，可以根据最新文献给出的经过验证的DefenseSystem来构建HMM模型去扩大已有检测范围；分析提供了原核基因组编码的抗病毒系统的全局视图，并揭示了跨生物体的抗病毒策略的高度多样性。